Benoît Noël
Ingénieur d’études en bioinformatique, Benoît Noël était en charge de l’analyse de données de séquençage -omiques complexes du laboratoire pour l’étude des mécanismes post-transcriptionnels affectant l’expression génique de cellules humaines lors de l’infection par Listeria monocytogenes.
Benoît est aussi co-développeur d’un logiciel universel de catégorisation des données de séquençage, permettant un contrôle-qualité des données expérimentales en amont de l’analyse statistique.
Expérience professionnelle
| Oct. 2015 – mai 2018 | CDD IE en bioinformatique, IBENS, Paris. Responsables : Alice Lebreton & Auguste Genovesio “Analyse de données de séquençage pour l’étude des mécanismes affectant l’expression génique de cellules humaines lors de l’infection par Listeria monocytogenes. ” |
| Fév.-juin 2015 | Stage de M2, IBENS, Paris. Responsables : Auguste Genovesio & Hervé Le Hir “Mise en place d’un pipeline d’analyse pour le traitement et le contrôle de données de Ribosome Profiling.” |
| Juin-juil. 2014 | Stage de M1 , IBENS, Paris. Responsable : Morgane Thomas-Chollier “Analyses bioinformatiques de données de ChIP-seq pour la prédiction d’éléments cis-régulateurs du gène Krox20.” |
Formation
| 2013-2015 | Master Bio-Informatique et Modélisation (BIM BMC), Mention Bien, Université Paris 6 Pierre et Marie Curie (UPMC), Paris. |
| 2011-2013 | Licence de Sciences du Vivant Mention Assez Bien, Université Paris 6 Pierre et Marie Curie (UPMC), Paris. |
| 2009-2011 | Première année commune aux études de santé (PACES), Université Paris 7 Denis Diderot, Paris |
| Juin 2009 | Baccalauréat Série Scientifique Lycée les Pierres Vives, Carrière sur Seine (78). |
Compétences
Informatique
- Programmation : Python (matplotlib, pandas, …), R, Bash, C
- Gestionnaires de versions : Git et Github
- Utilisation d’un cluster de calcul (HTCondor)
- Systèmes d’exploitation :Linux et Windows
- Web : Bases en HTML5, CSS3 et PHP
- Autres : LaTeX, Inkscape
Génomique
- Manipulation de données de séquençage à haut-débit : pré-traitement, alignement,
analyse différentielle.
Langues
- Anglais : niveau B1.
Vie associative
| Sept. 2016 – mai 2017 | Association “Young Researchers in Life Sciences” (YRLS). Organisation de la conférence scientifique YRLS2017 (administration du site web, production des différents visuels, organisation générale lors de l’événement). |
