Centre de Biologie Computationnelle (CBC)
L’IBENS soutient une recherche à vocation interdisciplinaire, combinant les techniques à haut-débit avec la biologie systémique et quantitative. Ce type de recherche implique la production et l’analyse automatisée de grandes quantités de données ainsi que le développement de méthodes et de modèles mathématiques. Ces modèles ont alors vocation à être validés en collaboration avec des équipes expérimentales.
Le Centre de Biologie Computationnelle de l’IBENS (CBC) vise à renforcer les synergies entre équipes et plateformes actives en biologie computationnelle à l’IBENS, ainsi que la visibilité de cet axe transversal au sein de l’Institut et au niveau national. Il fédère actuellement trois plateformes et six équipes de recherche en bioinformatique, modélisation des systèmes biologiques et bio-imagerie.
Outre des collaborations scientifiques entre membres du CBC, des animations sont proposées :
– Club Bioinformatique
– Club Machine Learning
– Séminaires scientifiques
– Listes de diffusion
– Organisation de symposia
– Ateliers de formation continue
Le CBC a aussi vocation d’interface avec l’enseignement de la biologie computationnelle, par une implication de ses membres dans la formation initiale à l’ENS, l’accueil de stagiaires et apprentis, la formation doctorale, et une participation active à la formation continue à l’IBENS et en France.
Le Centre de Biologie Computationnelle de l’IBENS développe de nombreux outils :
Outil | Équipe |
---|---|
AGORA | Hugues Roest Crollius |
Aozan | Plateforme Génomique |
BioNewMetrics | David Holcam |
Eoulsan | Plateforme Génomique |
EXOGEAN | Hugues Roest Crollius |
FINSURF | Hugues Roest Crollius |
Genomicus | Hugues Roest Crollius |
GINsim | Denis Thieffry |
mvMORPH | Hélène Morlon |
PhylDiag | Hugues Roest Crollius |
REGULUS | Hugues Roest Crollius |
RPANDA | Hélène Morlon |
RSAT | Denis Thieffry |
ToulligQC | Plateforme Génomique |
Ulm | Régis Ferrière / Sylvia De Monte |
Zen | Régis Ferrière / Sylvia De Monte |