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Centre de Biologie Computationnelle (CBC)


L’IBENS soutient une recherche à vocation interdisciplinaire, combinant les techniques à haut-débit avec la biologie systémique et quantitative. Ce type de recherche implique la production et l’analyse automatisée de grandes quantités de données ainsi que le développement de méthodes et de modèles mathématiques. Ces modèles ont alors vocation à être validés en collaboration avec des équipes expérimentales.

Le Centre de Biologie Computationnelle de l’IBENS (CBC) vise à renforcer les synergies entre équipes et plateformes actives en biologie computationnelle à l’IBENS, ainsi que la visibilité de cet axe transversal au sein de l’Institut et au niveau national. Il fédère actuellement trois plateformes et six équipes de recherche en bioinformatique, modélisation des systèmes biologiques et bio-imagerie.

Outre des collaborations scientifiques entre membres du CBC, des animations sont proposées :

 Club Bioinformatique
 Club Machine Learning
 Séminaires scientifiques
 Listes de diffusion
 Organisation de symposia
 Ateliers de formation continue

Le CBC a aussi vocation d’interface avec l’enseignement de la biologie computationnelle, par une implication de ses membres dans la formation initiale à l’ENS, l’accueil de stagiaires et apprentis, la formation doctorale, et une participation active à la formation continue à l’IBENS et en France.

Le Centre de Biologie Computationnelle de l’IBENS développe de nombreux outils :

OutilÉquipe
AGORA Hugues Roest Crollius
Aozan Plateforme Génomique
BioNewMetrics David Holcam
Eoulsan Plateforme Génomique
EXOGEAN Hugues Roest Crollius
FINSURF Hugues Roest Crollius
Genomicus Hugues Roest Crollius
GINsim Denis Thieffry
mvMORPH Hélène Morlon
PhylDiag Hugues Roest Crollius
REGULUS Hugues Roest Crollius
RPANDA Hélène Morlon
RSAT Denis Thieffry
ToulligQC Plateforme Génomique
Ulm Régis Ferrière / Sylvia De Monte
Zen Régis Ferrière / Sylvia De Monte