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Programmes de recherche

Notre projet combine deux approches bioinformatiques pour élaborer des modèles prédictifs de réseaux cellulaires intégrant signalisation, régulation transcriptionnelle et remodelage épigénétique.

La première approche s’appuie sur la suite bioinformatique RSAT pour analyser des jeux de données de génomique fonctionnelles (ChIP-seq, transcriptome) et caractériser les régions génomiques impliquées dans la régulation de l’expression génique.

La seconde approche s’appuie sur le développement du logiciel (GINsim) pour modéliser et analyser le comportement dynamique de grands réseaux de régulation et signalisation.

Ces développements sont appliqués à l’analyse intégrative du réseau de régulation contrôlant la spécification, la différenciation et la reprogrammation des cellules du sang, afin de prédire les effets de perturbations multiples, en collaboration avec plusieurs équipes expérimentales.

Les outils et modèles développés seront mis à la disposition de la communauté scientifique.

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